J'utilise le code suivant pour obtenir la moyenne de toutes les combinaisons possibles (m = 2) des variables dont le nom commence par "form".
> x<-2:8
> k=which(grepl("^form",colnames(data)))
> combined <- combn(data[,k], seq_along(x), FUN = rowMeans)
**Error in combn(data[, k], seq_along(x), FUN = rowMeans) :
length(m) == 1L is not TRUE**
> colnames(combined) <- combn(names(data[,k]), seq_along(x), paste0, collapse="")
**Error in combn(names(data[, k]), seq_along(x), paste0, collapse = "") :
length(m) == 1L is not TRUE**
> data <- cbind(data, combined)
L'ensemble de données "data" est le suivant:
x<-2:8
k=which(grepl("^form",colnames(data)))
combined <- combn(data[,k], seq_along(x), FUN = rowMeans)
colnames(combined) <- combn(names(data[,k]), seq_along(x), paste0, collapse="")
data <- cbind(data, combined)
Le code fonctionne bien et j'essaye de l'implémenter afin de prendre toutes les combinaisons possibles avec m de 2 à 8. J'ai essayé le code suivant, mais cela ne fonctionne pas.
structure(list(id = c(5309039, 5284969, 5300279, 5270289, 5259957,
5267086, 5173196, 5057536, 5246135, 5255558, 5241070, 5280194,
5112387, 444459, 5054590, 5048412, 5296390, 5093742, 5293520),
form13 = c(1300.81321145176, 1130.23869905075, 1292.03253463863,
1358.23586808642, 1250.66417156907, 1388.37813595599, 1277.89625553694,
1242.17552321015, 1275.95068420011, 1449.97932094858, 1494.93158409261,
1183.72005024492, 1319.72081010904, 1153.43556746197, 1451.47500658524,
1502.05308533551, 1641.66472289938, 1407.07852441646, 1444.3815517771
), form12 = c(1329.6, 1104.4, 1272, 1322.8, 1195.5, 1487.4,
1195.6, 1258, 1256.4, 1455, 1524, 1170, 1291.4, 1224.6, 1414,
1606, 1765.2, 1441, 1406.8), form11 = c(1325.578, 1201.752,
1346.42, 1424.884, 1328.03, 1367.262, 1294.928, 1278.99,
1330.482, 1493.54, 1524.19, 1242.21, 1379.522, 1178.458,
1438.37, 1475.15, 1611.236, 1426.11, 1431.014), form10 = c(1056.7264,
940.4956, 1076.29, 1149.9412, 1059.028, 1095.8536, 1027.9564,
1012.996, 1061.3296, 1214.386, 1243.156, 978.472, 1107.3616,
918.6304, 1162.6, 1197.124, 1324.8628, 1151.092, 1155.6952
), form9 = c(1265.95883621535, 1104.13796282321, 1292.61038190038,
1391.60226122629, 1269.10247448997, 1319.10781736395, 1226.47462059388,
1205.80097696249, 1272.24391797013, 1476.61400008329, 1514.11964245256,
1157.70450530205, 1334.62450699242, 1072.96302932, 1408.41424685422,
1453.98138963552, 1619.24856353662, 1393.1329826012, 1399.25113387699
), form8 = c(1482.14960970768, 1302.96011430734, 1455.11530997823,
1507.60187999797, 1403.62372119021, 1590.3115445541, 1392.70107590683,
1422.72772811208, 1440.68241714823, 1606.14610155669, 1656.53381495283,
1357.47229571355, 1476.63693689195, 1356.28387443873, 1567.80354390345,
1697.01564123702, 1829.93948069795, 1581.30521692185, 1561.45650301116
), form7 = c(1444.56088362196, 1256.09569669502, 1416.12716131828,
1471.33068319787, 1361.97012558123, 1558.32178921338, 1350.4820727773,
1382.06304580259, 1400.94715403591, 1574.97601740197, 1627.97203596215,
1313.42968513872, 1438.7628489193, 1312.17974558614, 1534.64866852904,
1670.54939207752, 1810.35399499291, 1548.84925168016, 1527.97307493173
), form6 = c(1199.39256844313, 1030.51525282711, 1173.91406615889,
1223.38008553142, 1125.38576782367, 1301.32988998026, 1115.09171006788,
1143.39035787661, 1160.31177216137, 1316.25318375141, 1363.74113364133,
1081.8903116367, 1194.19714454337, 1080.77028284113, 1280.11720270038,
1401.89327051093, 1527.16747332837, 1292.84186767351, 1274.13542778885
), form5 = c(1297.78687926793, 1159.12885718351, 1290.6491699916,
1344.46508388198, 1257.02131246849, 1368.96738018114, 1239.89545043121,
1250.12098970015, 1277.57642224122, 1419.04226152712, 1455.58342941928,
1202.60322079507, 1313.15664462902, 1177.98531965952, 1380.99558290387,
1461.37241431927, 1574.8610783177, 1384.16870680163, 1375.22939662201
), form4 = c(1335.97776730397, 1108.36308048125, 1324.2608292059,
1412.60257966574, 1269.05887158687, 1452.82443206729, 1240.94583733479,
1257.73161635649, 1302.80120256198, 1535.02507407783, 1595.00938916382,
1179.7286135352, 1361.20807332313, 1139.31698950533, 1472.56938122075,
1604.51232282192, 1790.81013902909, 1477.77823673001, 1463.10387273464
), form3 = c(1354.228, 1167.277, 1385.695, 1504.159, 1357.93,
1417.162, 1307.953, 1283.89, 1361.632, 1607.815, 1654.09,
1228.36, 1435.672, 1132.108, 1524.52, 1580.05, 1785.511,
1506.01, 1513.414), form2 = c(2275.7324829005, 1960.23260237236,
2259.163108513, 2384.94888103794, 2181.57337654262, 2442.86896126772,
2142.36120747078, 2165.7494001933, 2228.9072421228, 2562.48497832825,
2650.8148703194, 2057.68931533889, 2311.5302827576, 2002.33637794664,
2471.44922673607, 2664.88828208925, 2945.12448823488, 2479.00498842122,
2457.73611045874), form1 = c(1180.88828860349, 1056.82591443514,
1162.17101167316, 1198.5102427986, 1126.52065872992, 1255.77452231775,
1118.95833314255, 1139.74737411054, 1152.17835587263, 1266.73762443072,
1301.62370599969, 1094.56758356167, 1177.07157336578, 1093.7447765967,
1240.19104186727, 1329.65141749175, 1421.68162869499, 1249.53896489237,
1235.79664943772)), row.names = c(NA, -19L), class = c("tbl_df",
"tbl", "data.frame"))
>
car j'obtiens l'erreur suivante: p >
k=which(grepl("^form",colnames(data)))
combined <- combn(data[,k], 2, FUN = rowMeans)
colnames(combined) <- combn(names(data[,k]), 2, paste0, collapse="")
data <- cbind(data, combined)
Où me suis-je trompé?
Aussi, je voudrais ajouter le préphixe suivant "comb_" au nom de toutes les variables générées. Comment dois-je modifier le code ci-dessus?
Merci!
3 Réponses :
La fonction combn , ne peut prendre qu'un élément pour le nombre de combinaisons, vous devez donc utiliser lapply et enfin les combiner avec do.call (cbind ..):
D'abord nous définissons la fonction pour la combinaison x:
library(purrr) library(dplyr) combined = 2:8 %>% map(~as.tibble(func(.x,DATA=data[,k]))) %>% bind_cols()
Ensuite, nous itérons:
k=which(grepl("^form",colnames(data)))
combined = lapply(2:8,func,DATA=data[,k])
combined <- do.call(cbind, combined)
Si vous êtes familier avec purrr, vous peut aussi faire:
func = function(x,DATA){
mat = combn(DATA,x,FUN=rowMeans)
colnames(mat) = combn(names(DATA),x, paste0, collapse="")
mat
}
La raison est simplement que Cela vous donne une liste qui peut alors être Enfin, utilisez simplement combn ne prend qu'un m à la fois. Utilisez simplement sapply pour parcourir les m s. Afin d'obtenir les noms de colonnes en une seule étape, nous pouvons utiliser 'colnames . 'colnames est en fait le même que colnames (x) mais avec l'avantage que tout est sur le RHS. Les suffixes "form" peuvent être supprimés avec gsub.combined.2[1:5, c(1, 50, 100, 500, 1000, 5000)] # example columns
# comb.13.12 comb.9.1 comb.13.10.9 comb.13.10.2.1 comb.9.5.4.3 comb.13.7.6.5.4.3.2
# [1,] 1315.207 1223.424 1207.833 1453.540 1313.488 1458.356
# [2,] 1117.319 1080.482 1058.291 1271.948 1134.727 1258.836
# [3,] 1282.016 1227.391 1220.311 1447.414 1323.304 1448.835
# [4,] 1340.518 1295.056 1299.926 1522.909 1413.207 1528.446
# [5,] 1223.082 1197.812 1192.932 1404.447 1288.278 1400.515
cbind code> ed. combined.2 <- do.call(cbind, combined.2.lst)
dim(combined.2)
# [1] 19 7085
Résultat
k <- 2:14
combined.2.lst <- sapply(2:8, function(m)
`colnames<-`(combn(data[,k], m, rowMeans),
combn(names(data[,k]), m, function(x)
paste0("comb.", paste0(gsub("form", "", x), collapse=".")))))
cbind (data, combiné.2) .
Vous devez effectuer une itération sur m , en utilisant lapply () ou sapply () . J'ai essayé de conserver votre structure principale de votre code et d'apporter des modifications minimes pour le laisser fonctionner: m <- 2:8
k=which(grepl("^form",colnames(data)))
combined <- Reduce(cbind,lapply(m, function(m) combn(data[,k], m, FUN = rowMeans)))
colnames(combined) <-unlist(sapply(m, function(m) combn(names(data[,k]), m, paste0, collapse="")))
data <- cbind(data, combined)
Lorsque vous obtenez des erreurs avec votre code, il est vraiment utile d'inclure le texte textuel de l'erreur. Si vous obtenez à la place des résultats qui ne sont pas cohérents avec les données ou vos attentes, il est utile d'inclure la sortie, et soit / les deux en quoi elle est incorrecte et quelle devrait être la sortie attendue. Puisque nous n'avons pas vos
données(mauvaise pratique d'utiliser cela comme nom de variable, btw), il est difficile de reproduire quoi que ce soit localement.Merci r2evans! J'ai édité le post en suivant vos suggestions!