R Markdown: Comment faire flotter le texte autour des figures?

Pour autant que je sache, vous pouvez intégrer du code HTML dans un document de démarquage, donc si vous tricotez en HTML, vous pouvez faire quelque chose comme ceci:

Enveloppez la cellule avec un div balise avec le style d'alignement que vous souhaitez (plus besoin d'aligner la cellule), et comme pour la légende, vous pouvez ajouter une boîte transparente en bas avec la légende comme texte à l'intérieur

<div style="float:right">
```{r flowchart-data, echo = FALSE, message = FALSE, fig.width = 7, fig.height = 6}
library(grid)
library(Gmisc)

grid.newpage()
# set some parameters to use repeatedly
leftx <- .2
midx <- .5
rightx <- .8

myBoxGrob <- function(text, ...) {
  boxGrob(label = text, bjust = "top", box_gp = gpar(fill = "lightgrey"), ...)
}

# create boxes

(Pharmazie <- myBoxGrob("Verbrauchsdaten von der\n Spitalpharmazie  (Excel-Tabelle)", x=leftx, y=1, width = 0.36))
(Finanzen <- myBoxGrob("Belegzahlen vom Ressort\n Finanzen (Excel-Tabelle)", x=rightx, y=1, width = 0.36))
(A <- myBoxGrob("Import der Daten aus Excel ins\n Microsoft Access (Datenbanksoftware)", x=midx, y=0.83, width = 0.45))
(B <- myBoxGrob("Zusammenführen der Informationen\n und erstellen neuer, berechneter Tabellen", x=midx, y=.66, width = 0.45))
(C <- myBoxGrob("Export der neu erstellten Tabellen\n in Form von Excel-Tabellen", x=midx, y=.49, width = 0.45))
(D <- myBoxGrob("Import der neuen Tabellen in R", x=midx, y=.32,  width = 0.45))
(E <- myBoxGrob("Berechnung und grafische Darstellung\n der Grafiken und Tabellen", x=midx, y=.19, width = 0.45))
(caption <- boxGrob(label = 'Ablauf der Datenverarbeitung',  x=midx, y=.02, box_gp = gpar(alpha=0)))

connectGrob(Pharmazie, A, "L")
connectGrob(Finanzen, A, "L")
connectGrob(A, B, "N")
connectGrob(B, C, "N")
connectGrob(C, D, "N")
connectGrob(D, E, "N")

```
</div>
And this is the text that would go to the left of the chart.

Il existe une option chunk appelée fig.env avec laquelle on peut passer de l'environnement figure à l'environnement marginfigure . Malheureusement, la liste des environnements possibles n'inclut pas wrapfigure . Par conséquent, nous allons modifier le bloc de l'intrigue:

---
header-includes:
  - \usepackage{wrapfig}
  - \usepackage{lipsum}
output: 
  pdf_document:
    keep_tex: true
---

```{r, include = F}
defOut <- knitr::knit_hooks$get("plot")  # save the default plot hook 
knitr::knit_hooks$set(plot = function(x, options) {  # set new plot hook ...
  x <- defOut(x, options)  # first apply the default hook
  if(!is.null(options$wrapfigure)) {  # then, if option wrapfigure is given ...
    # create the new opening string for the wrapfigure environment ...
    wf <- sprintf("\\begin{wrapfigure}{%s}{%g\\textwidth}", options$wrapfigure[[1]], options$wrapfigure[[2]])
    x  <- gsub("\\begin{figure}", wf, x, fixed = T)  # and replace the default one with it.
    x  <- gsub("{figure}", "{wrapfigure}", x, fixed = T)  # also replace the environment ending
  }
  return(x)
})
```


Vivamus vehicula leo a justo. Quisque nec augue. Morbi mauris wisi, aliquet vitae, dignissim eget, sollicitudin molestie, ligula. In dictum enim sit amet risus. Curabitur vitae velit eu diam rhoncus hendrerit. Vivamus ut elit. Praesent mattis ipsum quis turpis. Curabitur rhoncus neque eu dui. Etiam vitae magna. Nam ullamcorper. Praesent interdum bibendum magna. Quisque auctor aliquam dolor. Morbi eu lorem et est porttitor fermentum. Nunc egestas arcu at tortor varius viverra. Fusce eu nulla ut nulla interdum consectetuer. Vestibulum gravida. 

```{r echo = F, warning = F, message = F, fig.width=7, fig.height = 6, out.width = ".7\\textwidth", fig.cap = "My Flowchart", fig.align="right", wrapfigure = list("R", .7)}
plot(mpg ~ hp, data = mtcars)
```

Morbi mattis libero sed est. Vivamus vehicula leo a justo. Quisque nec augue. Morbi mauris wisi, aliquet vitae, dignissim eget, sollicitudin molestie, ligula. In dictum enim sit amet risus. Curabitur vitae velit eu diam rhoncus hendrerit. Vivamus ut elit. Praesent mattis ipsum quis turpis. Curabitur rhoncus neque eu dui. Etiam vitae magna. Nam ullamcorper. Praesent interdum bibendum magna. Quisque auctor aliquam dolor. Morbi eu lorem et est porttitor fermentum. Nunc egestas arcu at tortor varius viverra. Fusce eu nulla ut nulla interdum consectetuer. Vestibulum gravida. Morbi mattis libero sed est.

Les commentaires devraient clarifier ce que nous faisons réellement ici. Notez que la valeur attendue de wrapfigure est une liste de deux éléments. Le premier dit à LaTeX de déplacer la figure de chaque côté de la page. Le deuxième élément indique à LaTeX la largeur de la figure enveloppée. Pour déplacer une figure d'une largeur de 0,7 \\ textwidth vers la droite, définissez wrapfigure = list ("R", 0.7) (comme vous l'avez peut-être deviné, L le déplace vers la gauche). Tout ce que nous avons à faire maintenant est d'inclure le package wrapfig dans le YAML et de définir cette option de bloc. Voici un exemple reproductible:

defOut <- knitr::knit_hooks$get("plot")  # save the default plot hook 
knitr::knit_hooks$set(plot = function(x, options) {  # set new plot hook ...
  x <- defOut(x, options)  # first apply the default hook
  if(!is.null(options$wrapfigure)) {  # then, if option wrapfigure is given ...
    # create the new opening string for the wrapfigure environment ...
    wf <- sprintf("\\begin{wrapfigure}{%s}{%g\\textwidth}", options$wrapfigure[[1]], options$wrapfigure[[2]])
    x  <- gsub("\\begin{figure}", wf, x, fixed = T)  # and replace the default one with it.
    x  <- gsub("{figure}", "{wrapfigure}", x, fixed = T)  # also replace the environment ending
  }
  return(x)
})

Notez que cette solution ne fonctionne très probablement qu'avec un bloc créant un seul tracé. Cela devrait être possible dans la mesure où à un bloc contenant plusieurs chiffres.

J'ai eu beaucoup de mal avec ça aussi, mais pour la sortie html. Il y a un argument au bloc r qui a résolu le problème pour moi:

out.extra = 'style = "float: right; padding: 10px"'