J'ai récemment mis à jour mon MacBook Air (2017) sur le système d'exploitation Mojave et a procédé à mettre à jour ma version de R et RStudio. Malheureusement, depuis que la commande "plottangentspace" ne fonctionne plus de manière appropriée, même lors de la tentative d'exécution de l'exemple du code "Pléthodon" de la Vingette Geomorphe, je reçois toujours l'erreur suivante dans la sortie (en gras ci-dessous):
données (pléthodon)
Y.gpa <-gpagen (terrains de pléthodon $) # GPA-alignement | ================================================= =================================== | 100%
GP <- Interaction (espèces de pléthodon $, Pléthodon $ Site)
PLOTTANGENTSPACE (Y.GPA $ coords, groupes = GP)
ERREUR ERREUR EN PLOTTANGENTSPACE (Y.GPA $ Coords, Groupes = GP): Arguments non utilisés (y.gpa $ coords, groupes = gp) J'ai essayé de désinstaller et de réinstaller R pour une MacOS plusieurs fois, y compris les versions 4.0.2, 3.6.3, 3.6.1 et 3.2.1. J'ai également désinstallé et réinstallé Xquartz plusieurs fois.
Si quelqu'un a rencontré un problème similaire ou que d'autres idées que je peux essayer, j'apprécierais vraiment l'aide. Merci!
3 Réponses :
Si vous exécutez:
install.packages("geomorph")
Merci beaucoup pour votre conseil! J'avais déjà rencontré cette nouvelle fonction auparavant, mais n'a eu aucun succès avec son utilisation. Lorsque j'exécute le code d'échantillon, j'obtiens l'erreur suivante (gras ci-dessous):> Données (PLETHSPeciies)> Y.GPA <- GPAGEN (PLETHSPECIES $ TERRUEL) # GPA-Alignement | ============= =============================================== = =================== ===== | 100%> ### PCA traditionnel> PCA <- GM.PCOMP (Y.GPA $ coords) Erreur dans do.call (ordonnée, ord.args): objet 'Ordinated' introuvable
Vous devez exécuter packagedescription ("geomorph") , vérifier la version et ma prédiction est qu'il est obsolète.
J'apprécie vraiment votre aide! Lorsque j'exécute ce code, il semble que le package est à jour (version 3.3.1 dans R 3.6.2), je reçois la sortie suivante: Package: Geomorph Titre: Analyses morphométriques géométriques de 2D / 3D Données de repère: 3.3. 1
Je pense que j'ai trouvé le problème! Dans mon cas, l'erreur était due à une ancienne version du package RRPP, qui est requise par Geomorphe. Après la mise à jour, Geomorph travaille parfaitement! J'espère que cela peut être utile pour vous aussi.
Je suis tombé sur la même erreur, mais après la mise à jour des packages RRPP et RGL requis pour Geomorph, la fonction GM.PCOMP () a fonctionné pour moi. J'espère que cela vous aidera si vous ne l'avez pas déjà compris.
Vous n'avez pas posté une bibliothèque appel appel ou les résultats de
sessionInfo () , nous ne savons donc pas si vous avez une version actuelle et que vous l'avez chargée dans votre espace de travail.